10 червня 2016 року Євген Кисельов повідомив про порушення проти нього кримінальної справи у
Російській Федерації через його висловлювання на підтримку
Надії Савченко[4][5]. За його словами справа відкрита за ст. 205.2 Кримінального кодексу РФ (публічні заклики до здійснення терористичної діяльності або публічне виправдання тероризму) з максимальною мірою покарання 7 років позбавлення волі. Євген Кисельов у відкритому зверненні до Президента України Петра Порошенко закликав на державному рівні вирішити питання про надання політичного притулку російським опозиціонерам.